乳腺癌是妇女最常见的恶性肿瘤之一,目前发病年龄提前,发病率上升,5%~10%的乳腺癌患者伴有遗传基因突变,具有明显的家族遗传倾向。相关遗传基因的发现可实现在分子水平早期诊断乳腺癌,尽早采取预防措施,减少乳腺癌的死亡率。近期,英国伦敦癌症研究所(ICR)的研究人员通过新的高通量遗传分析技术发现了110个乳腺癌相关基因,进一步拓宽了乳腺癌相关基因谱。
研究人员通过一种被称为CaptureHi-C(CHi-C)的高通量遗传分析技术,分析了过往全基因组关联研究(GWAS)中发现的乳腺癌相关的63个基因座,将这些基因组中的110个基因与乳腺癌风险增加联系起来,同时发现其中32个基因与乳腺癌存活相关联。该研究结果以《CaptureHi-Cidentifiesputativetargetgenesat33breastcancerriskloci》为题在线发表在3月12日的《NatureCommunications》上。 在过往的研究中,研究人员发现大多数乳腺癌发病风险有关的单核苷酸多态性(SNPs)多定位于基因组的非蛋白编码区域,在调节基因转录中发挥作用,而其他与乳腺癌发病发生发展的位点可能位点则位于被称为“基因沙漠”的基因组区域内,这些区域附近的基因可能含有数百千碱基,可编码多种蛋白质。 要从“基因沙漠”中找出哪些基因是乳腺癌风险相关基因极具挑战性,因为这些基因多数与它们的调控元件彼此远离,只有当相应的DNA环路形成时,这些调控元件与靶基因才能产生物理相互作用,这对遗传分析技术提出了极高的要求。 经过努力,ICR的研究人员开发出了高通量、高分辨率高保真的遗传分析技术—CHi-C,以鉴定调控元件与其靶基因间的物理相互作用,这一技术不受调控元件和靶基因的距离限制。他们利用该技术分析了过往GWAS中发现的乳腺癌相关的63个基因座(其中包含大量“基因沙漠”区域),在其中33个基因座中发现了110个乳腺癌风险相关的靶基因,包括94个蛋白质编码基因和16个非编码RNA,其余30个基因区域中未鉴定出特定的基因。 令人惊喜的是,这些基因的大多数在过往的研究中并未与乳腺癌风险相关,这就有效拓宽了乳腺癌风险的基因谱!